Moderný podnikateľ pri analýze firemnej štruktúry a cash-flow na obrazovke v presklenej zasadačke.

Zmeny v DPH od roku 2026: Povinná skupinová registrácia pre prepojené firmy?

Koniec samostatnosti pre s.r.o. v holdingoch a prepojených firmách?

Zatiaľ čo doteraz bola skupinová registrácia pre skupiny prepojených podnikov (často zjednodušene označované ako holdingy) šikovným a dobrovoľným nástrojom na optimalizáciu cash-flow a zníženie administratívy pri vnútroskupinových transakciách, od roku 2026 bude štát túto štruktúru vymáhať direktívne. Čo to pre váš systém a nastavené procesy znamená?

💡 Nejde len o „veľké holdingy“

Hoci v biznisovom žargóne často používame slovo holding, zákon o DPH sa neobmedzuje len na formálne štruktúry materskej a dcérskej spoločnosti. Nové pravidlá sa týkajú akejkoľvek skupiny firiem, ktoré sú navzájom prepojené.

Typický príklad z praxe: Podnikateľ vlastní tri samostatné s.r.o. (tzv. sesterské spoločnosti) – jednu na stavebnú činnosť, druhú na prenájom nehnuteľností a tretiu na účtovníctvo. Tieto firmy zdieľajú rovnaké kancelárie a občas si vzájomne fakturujú služby. Hoci formálne netvoria holding, pre Finančnú správu to bude od roku 2026 jedna skupina.

Ekonomické, finančné a organizačné prepojenie pod drobnohľadom

Cieľom tejto zmeny je eliminácia systémových daňových únikov a takzvaných reťazových podvodov. Finančná správa začne aktívne vyhľadávať spoločnosti, ktoré navonok vystupujú samostatne, ale fakticky tvoria jeden celok.

Úrady vás automaticky zaradia do jednej skupiny pre účely DPH, ak vaše firmy spĺňajú podmienku tzv. trojitého prepojenia:

Finančné: Spoločná majetková štruktúra (napr. matka a dcéra, alebo ten istý konečný užívateľ výhod pre viaceré s.r.o.).
Ekonomické: Firmy pôsobia v rovnakom odvetví, vzájomne sa dopĺňajú, alebo jedna existuje takmer výhradne pre zabezpečenie potrieb tej druhej.
Organizačné: Zdieľaný manažment, spoločné priestory (rovnaké sídlo), prekrývajúci sa personál.

Ak systém Finančnej správy vyhodnotí zhodu, stratíte pre účely nepriamych daní svoju samostatnú právnu subjektivitu. Skupina dostane jediné IČ DPH a bude podávať len jedno (spoločné) daňové priznanie.

Dopady na váš cash-flow a manažment rizík

Aby ste sa mohli na zmenu strategicky pripraviť, prinášame vám prehľadné zhrnutie procesných rozdielov:

Dopady povinnej skupinovej registrácie k DPH

Oddelená DPH (Dnes) vs. Skupinová DPH ex offo (Od roku 2026)

Proces v štruktúre firiemOddelená DPH (Dnes)Skupinová DPH ex offo (Od 2026)
Fakturácia medzi vašimi firmamiBežná fakturácia s DPH (vplyv na cash-flow).Bez uplatnenia DPH (transakcie nie sú zdaniteľným plnením).
Podávanie daňových priznaníKaždá spoločnosť podáva priznanie samostatne.Len jedno spoločné DP k DPH za celú skupinu.
Zodpovednosť za daňové nedoplatkyIzolované riziko (1 firma = 1 zodpovednosť).Solidárne ručenie celej skupiny.

Kľúčové riziko: Solidárne ručenie a prísne sankcie

Ak sa vaše podnikanie neustále rozrastá, pravdepodobne zakladáte nové firmy práve na oddelenie rizika (napr. riskantnejší projekt v jednej s.r.o., nehnuteľnosti v druhej). Z hľadiska DPH tento „firewall“ od roku 2026 môže padnúť..

Pokiaľ jedna z firiem v povinnej skupine DPH neuhradí, štát uplatní inštitút solidárneho ručenia a zinkasuje nedoplatok od akejkoľvek inej zdravej firmy vo vašej štruktúre. Zároveň upozorňujeme, že novela Daňového poriadku výrazne sprísňuje sankcie za správne delikty.

Čas na systémový audit je teraz

Vzhľadom na aktuálnu účinnosť nových pravidiel a rastúcu agresivitu Finančnej správy v oblasti analytického vyhľadávania väzieb je nevyhnutné, aby subjekty spĺňajúce kritériá prepojenosti vykonali interný audit svojej štruktúry.

Na čo presne by ste sa mali pri systémovom audite zamerať?

Dokumentácia ekonomickej podstaty: Každé rozdelenie aktivít medzi viacero firiem by malo byť podložené „Business Case“ štúdiou, ktorá definuje ekonomické, prevádzkové a právne dôvody separácie. Ak sú firmy prepojené personálne aj finančne, ale ich ekonomické ciele sú skutočne odlišné (napr. jedna firma vyrába nábytok a druhá prevádzkuje IT portál pre nesúvisiacu klientelu), musí byť táto oddelenosť jasne doložiteľná nezávislou fakturáciou, samostatnými webovými prezentáciami a oddeleným personálom.

Revízia zmluvných vzťahov a transferových cien: Aj v rámci skupiny neplatiteľov je nutné dbať na trhové princípy. Pokiaľ si firmy medzi sebou fakturujú služby za ceny zjavne nezodpovedajúce realite, dáva to správcovi dane silný argument o účelovosti štruktúry. Od roku 2026 bude neoznámenie transferovej dokumentácie na výzvu úradu sankcionované až do výšky 10 000 EUR.

Príprava na administratívu skupiny: Ak vyhodnotíte, že vaša štruktúra je ťažko obhájiteľná, môže byť ekonomicky výhodnejšie zvážiť dobrovoľnú skupinovú registráciu čo najskôr ako formu „damage control“. Zatiaľ čo dobrovoľná registrácia prebehne bez hrozby registračných sankcií od momentu rozhodnutia, dôležité je vedieť, že registrácia do skupiny (či už dobrovolná, alebo ex offo) nefunguje spätne. Ak bola štruktúra doteraz účelová na obchádzanie DPH, hrozí riziko domerania dane, penále a úrokov z omeškania za predchádzajúce obdobia.

Záverom možno konštatovať, že skupinová registrácia z moci úradnej je mocným nástrojom, ktorý zásadne mení pravidlá hry na slovenskom trhu. Podnikatelia, ktorí doteraz spoliehali na legálne, no účelové drobenie obratu, sa musia pripraviť na to, že ich konkurenčná výhoda môže s príchodom roku 2026 zaniknúť, a to za sprievodu vysokých pokút a hrozby solidárneho ručenia za chyby partnerov v skupine.

V Emmitax rozumieme potrebám rastúcich firiem. Radi sa postaráme o to, aby vaše účtovníctvo a daňová agenda boli stopercentne pripravené na novú legislatívu a vy ste mali všetky doklady a daňové priznania v úplnom poriadku bez stresu z kontrol.

Potrebujete pomôcť so správnym nastavením účtovníctva pre vaše prepojené s.r.o. a zabezpečiť bezchybné podávanie spoločného daňového priznania k DPH? Prečítajte si viac o našich službách a dohodnite si nezáväznú konzultáciu. Neponechávajte nič na náhodu a zverte svoju administratívu do rúk profesionálom.

Chcem nezáväznú konzultáciu

Použité zdroje a užitočné odkazy:

Zmeny v daňových sankciách a pokutách od 1. 1. 2026: fakturaonline.sk
Finančná správa SR – Novela Daňového poriadku: financnasprava.sk/sk/pre-media/novinky…
Slovensko-nemecká obchodná a priemyselná komora (AHK Slowakei) – Daňové pokuty: slowakei.ahk.de